萨摩耶和土狗配聪明吗？
首先，从品种上来讲，不存在所谓的“土狗”这个概念，我们常说的土狗其实是指中华田园犬； 至于你说到的串种问题，理论上讲任何动物都可能会有串种的问题，不过一般来说意义不大（当然，你非要做实验排除意外情况，那也没人拦着你），因为自然界的物种都是混血繁殖的，而且很多时候连亲缘关系都很遥远，比如人类就是混血非常严重的例子；
关于纯合的问题，在判断是否有遗传病风险的时候是有意义的，不过在评估是否会更聪明这一点上没什么意义，因为大脑是个非常复杂的器官，影响智力的因素很多，基因只是其中一部分，甚至可能不是很重要的部分。 所以，结果无非就是两种：
第一种结果是，两个没经人工干预的自然繁殖的狗狗生出来的宝宝很可能比较像父母，也就是比较聪明；但这种情况下的聪明应该只是相对而言的聪明，肯定不可能像人一样智力有高低之分。
第二种结果，两只狗狗因为近亲的原因，导致某些隐性基因突变成了显性基因，从而出现某些遗传病症或者智商问题的概率变大。不过，虽然会有大概率生成弱智的狗狗，但这一般都是纯合的情况下才会发生，而你要做的是判断你的串种狗狗是否存在纯合的可能，这点你可以放心，概率很低。